临床肿瘤学杂志

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采用染色质免疫沉淀联合芯片技术分析胃癌全基因组蛋白H3K27三甲基化水平

钟克力1,张 丽2,戴 勇2,周汉新2,王春友1   

  1. 1 华中科技大学同济医学院附属协和医院普外科 2 广东省深圳市人民医院胃肠外科
  • 收稿日期:2008-10-16 修回日期:1900-01-01 出版日期:2009-01-25 发布日期:2009-01-25
  • 通讯作者: 钟克力

GenomewideanalysisofhistoneH3lysine27trimethylationbyChIPchipingastriccance

  • Received:2008-10-16 Revised:1900-01-01 Online:2009-01-25 Published:2009-01-25

摘要:  【摘 要】 目的:研究胃癌细胞全基因组蛋白H3K27的三甲基化水平。方法:收集我科2007年10月~2008年1月间8
例胃癌患者的病灶组织和正常胃黏膜组织,采用染色质免疫沉淀联合芯片技术(ChIPchip)在全基因组范围内对两种组织细
胞的组蛋白H3K27进行高通量的检测。随后采用染色质免疫沉淀实时定量聚合酶联反应(ChIPqPCR)验证芯片结果,定量
反转录聚合酶联反应(qRTPCR)检测H3K27显著差异基因的mRNA表达水平。用统计软件进行基因筛选。结果:经两种组
织细胞组蛋白H3K27三甲基化水平对比,筛选出234个基因存在H3K27显著差异,肿瘤细胞中有71个基因显示有H3K27三
甲基化程度增高,161个基因H3K27甲基化程度降低;ChIPqPCR验证结果与CpG岛芯片检测结果一致。结论:和正常胃黏
膜组织细胞相比,胃癌细胞多个基因组蛋白H3K27三甲基化存在显著改变。ChIPchip检测技术有利于进一步揭示胃癌发生
的分子机制,发现新的基因治疗靶点。

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